Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4AQ9H3S1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4AQ9H3S1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms