Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRDQ9H2X0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRDQ9H2X0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRDQ9H2X0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRDQ9H2X0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRDQ9H2X0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRDQ9H2X0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRDQ9H2X0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms