Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ9H0N0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms