Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LSG1Q9H089 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms