Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRTNQ9H040 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms