Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN2Q9H000 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN2Q9H000 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms