Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRCC1Q9C099 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRCC1Q9C099 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms