Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
NLRP1Q9C000 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NLRP1Q9C000 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP1Q9C000 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms