Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIH1Q9BYX4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIH1Q9BYX4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFIH1Q9BYX4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1868.5 ms