Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A8Q9BY19 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A8Q9BY19 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A8Q9BY19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A8Q9BY19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A8Q9BY19 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms