Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSPO3Q9BXY4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms