Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS5

AP1M1, AP-1 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1M1Q9BXS5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP1M1Q9BXS5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1M1Q9BXS5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1M1Q9BXS5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms