Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MXD3Q9BW11 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MXD3Q9BW11 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MXD3Q9BW11 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms