Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK2Q9BVS4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms