Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAMP8Q9BV40 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms