Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf16Q9BUW7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms