Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms