Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF559Q9BR84 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms