Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP3Q9BQQ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms