Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BPIFA3Q9BQP9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms