Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf43Q9BQ61 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C19orf43Q9BQ61 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf43Q9BQ61 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms