Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SIN3AQ96ST3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIN3AQ96ST3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms