Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRAMP1Q96RY5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms