Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC1Q96RQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC1Q96RQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms