Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU0

CNTNAP3B, Contactin-associated protein-like 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3BQ96NU0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP3BQ96NU0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP3BQ96NU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP3BQ96NU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms