Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC115Q96NT0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms