Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms