Protein–RNA interactions for Protein: Q96MZ0

GDAP1L1, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP1L1Q96MZ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDAP1L1Q96MZ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP1L1Q96MZ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP1L1Q96MZ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms