Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG8Q96MW5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG8Q96MW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG8Q96MW5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms