Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCZQ96LD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCZQ96LD1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms