Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX27Q96L92 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms