Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPGRIP1Q96KN7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms