Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.33■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I2Q96KJ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX4I2Q96KJ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms