Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABS1Q96KC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms