Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPTM1LQ96KA5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms