Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
JPH4Q96JJ6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
JPH4Q96JJ6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms