Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB8

MPP4, MAGUK p55 subfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP4Q96JB8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MPP4Q96JB8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MPP4Q96JB8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms