Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK5RAP3Q96JB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms