Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSL1Q96IY1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSL1Q96IY1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms