Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MS4A3Q96HJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A3Q96HJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A3Q96HJ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.9 ms