Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASIC4Q96FT7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms