Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEIL1Q96FI4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEIL1Q96FI4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEIL1Q96FI4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms