Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CMTM5Q96DZ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms