Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP27Q96DN0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms