Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHISA4Q96DD7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHISA4Q96DD7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHISA4Q96DD7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms