Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC39Q96DD0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms