Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1AQ96CP6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms