Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC127Q96BQ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC127Q96BQ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms