Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3DQ96BQ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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FAM3DQ96BQ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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FAM3DQ96BQ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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FAM3DQ96BQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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FAM3DQ96BQ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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FAM3DQ96BQ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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FAM3DQ96BQ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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FAM3DQ96BQ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM3DQ96BQ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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FAM3DQ96BQ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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FAM3DQ96BQ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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