Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VOPP1Q96AW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms